中新社成都5月29日电 (贺劭清 张喆)记者29日从四川农业大学获悉,四川农业大学国家重点实验室、水稻研究所李仕贵与钦鹏教授团队团结中科院遗传与发育生物学研究所梁承志研究员团队剖析展现了水稻基因组中的“隐藏”变异。

这一研究功效以《基于33个水稻遗传多样性质料的泛基因组剖析展现“隐藏”的基因组变异》为题,于北京时间28日深夜由国际着名学术期刊《细胞》(Cell)在线揭晓。

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四川农业大学和中科院团队选取了具有高度代表性的33个水稻质料,接纳最新的第三代基因测序手艺,对其中31份质料举行了长片断测序、高质量基因组组装及基因注释。连系已报导的日本晴和蜀恢498两个质料的参考基因组,经由系统的对照剖析,共判断到171072个基因结构性变异和22549个基因拷贝数变异。

这些基因组变异无法行使传统手段判断到,绝大多数在先前研究中均未被发现,但在主要农艺性状调控中施展主要作用。如着名优质稻品种“越光”中一个早熟位点(qDTH7-3),很可能就是由OsMADS18基因在“越光”发生两个拷贝,导致基因表达量升高从而显示早熟表型。

此次研究历程中,中国科研职员还首次构建了水稻图形基因组,是水稻中迄今最为完整的基于图形结构的泛基因组。为了利便宽大研究职员使用相关数据,他们还搭建了网站,便于使用基因组序列和查询遗传变异等内容,促进水稻功效基因组学和育种应用研究。

李仕贵示意,此研究打开了却构变异研究的大门,将有助于加速水稻功效基因组学和分子设计育种研究,为选育高产优质、绿色平安水稻新品种提供基础支持。接下来团队将把研究功效运用到应用基础研究和育种事情中,力争培育出更多产量高、品质好、抗性强的水稻品种。(完)


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